Glassubstrate werden speziell wegen ihrer optischen Eigenschaften ausgewählt, z. B. wegen ihrer hohen Transparenz für sichtbares Licht und in einigen Fällen auch für längere Wellenlängen. Es gibt verschiedene Arten von Glassubstraten, von denen jedes seine eigenen einzigartigen Eigenschaften und Anwendungen hat. Gängige Beispiele sind Kalknatronglas, Borosilikatglas, Quarzglas und Spezialgläser wie Quarzglas oder Saphir.
Kalknatronglas ist aufgrund seiner geringen Kosten, seiner guten optischen Transparenz und seiner einfachen Herstellung das am häufigsten verwendete Glassubstrat. Es wird häufig für alltägliche Anwendungen wie Fenster, Bildschirme und Linsen verwendet. Borosilikatglas hingegen bietet eine höhere Widerstandsfähigkeit gegenüber thermischen Belastungen und wird häufig für Hochtemperaturanwendungen wie Laborglas und optische Komponenten für die Beleuchtung verwendet.
Quarzglas, das aus hochreinem Siliziumdioxid hergestellt wird, ist hochgradig transparent für ultraviolettes (UV-)Licht und hat eine ausgezeichnete thermische und chemische Beständigkeit. Es wird häufig in Anwendungen eingesetzt, die UV-Transparenz erfordern, wie z. B. Optiken für die UV-Spektroskopie, die Halbleiterherstellung und die Fotolithografie.
Spezialgläser wie Quarzglas und Saphir bieten außergewöhnliche optische Eigenschaften. Quarzglas hat einen extrem niedrigen Wärmeausdehnungskoeffizienten und eignet sich daher für Anwendungen, die eine hohe Dimensionsstabilität und Temperaturwechselbeständigkeit erfordern, wie z. B. Präzisionsoptiken und Lasersysteme. Saphir, eine einkristalline Form von Aluminiumoxid, ist hochtransparent und besitzt eine ausgezeichnete mechanische Festigkeit. Es wird in Hochleistungsoptiken, kratzfesten Fenstern und Hochleistungslasersystemen verwendet.